Organik sentez laboratuvarları için havalandırma sistemleri, komple laboratuvar donanım çalışmalarının en yüksek maliyetli, en düşük arıza toleranslı ve en zor sonradan değiştirilebilen bileşenini temsil eder. Temel tasarım hedefleri şunlardır: 1. Yanıcı ve zehirli VOC buharlarını zamanında dışarı atın; 2. Komşu alanlara koku sızmasını önlemek için iç mekanda sabit negatif basıncı koruyun; 3. Havalandırma kanalları içindeki organik çözücü buharlarının konsantrasyonunu alt patlama limitinin (LEL) altında tutun; 4. Yüksek hacimli egzoz havasının neden olduğu iç mekan sıcaklık ve nemindeki ani dalgalanmalardan kaçının. Komple havalandırma sistemi altı temel alt sistemden oluşmaktadır: yerel egzoz havalandırması (esas olarak çeker ocaklar), genel oda egzozu, taze hava beslemesi, kanal boruları, atık gaz arıtma ve otomatik kilitleme kontrolü. Her bir alt sistem, tasarım ve yapım açısından kendine özgü zorluklar içermektedir.