Les systèmes de ventilation des laboratoires de synthèse organique représentent l'élément le plus coûteux, le moins tolérant aux pannes et le plus difficile à moderniser lors de l'aménagement complet d'un laboratoire. Leurs principaux objectifs de conception sont les suivants : 1. Évacuer rapidement les vapeurs de COV inflammables et toxiques ; 2. Maintenir une pression négative intérieure stable pour empêcher les fuites d'odeurs vers les zones adjacentes ; 3. Maintenir la concentration de vapeurs de solvants organiques à l'intérieur des conduits en dessous de la limite inférieure d'explosivité (LIE) ; 4. Éviter les fluctuations importantes de la température et de l'humidité intérieures causées par un volume élevé d'air extrait. Le système de ventilation complet se compose de six sous-systèmes principaux : ventilation par aspiration localisée (principalement des hottes aspirantes), extraction générale des locaux, apport d’air neuf, réseau de gaines, traitement des gaz résiduaires et système de contrôle automatisé. Chaque sous-système présente des défis spécifiques en matière de conception et de construction.