ความสัมพันธ์ระหว่าง GEP และ GMP: GMP สำหรับการออกแบบโรงงานผลิตยาเน้นที่การควบคุมคุณภาพของผลิตภัณฑ์ในระหว่างกระบวนการผลิต
GEP ให้ความสำคัญกับการควบคุมคุณภาพของโครงการในระหว่างการก่อสร้าง การควบคุมนี้ครอบคลุมไปถึงกระบวนการทั้งหมด ตั้งแต่การเริ่มต้นโครงการ การออกแบบ ไปจนถึงการรับมอบงาน หากปราศจากการควบคุมโดยรวม การควบคุมกระบวนการก่อสร้างก็ไร้ความหมาย เพราะการก่อสร้างนั้นขึ้นอยู่กับการออกแบบ และการออกแบบนั้นถูกกำหนดโดยความต้องการของผู้ใช้งาน
GEP เป็นรากฐานและหลักประกันสำหรับการนำ GMP ไปใช้ โครงการที่ออกแบบและก่อสร้างอย่างเคร่งครัดตามขั้นตอน GEP สำหรับการออกแบบโรงงานผลิตยาจะช่วยให้มั่นใจได้ว่าโครงการที่ส่งมอบขั้นสุดท้ายตรงตามข้อกำหนด GMP และความต้องการในการผลิตอย่างครบถ้วน ป้องกันข้อบกพร่องในการออกแบบหรือสภาวะที่ไม่สามารถใช้งานได้ซึ่งอาจพบในระหว่างการใช้งานประจำวัน สิ่งนี้รับประกันได้อย่างแข็งแกร่งถึงการนำ GMP ไปใช้ได้อย่างราบรื่น
โครงการที่ดำเนินการตาม GEP นั้นไม่ได้ให้เพียงแค่บันทึกการก่อสร้างที่แยกต่างหาก แต่จะให้รายงานที่มีโครงสร้างอย่างเป็นระบบและสอดคล้องกับ GMP